Los personajes se crean con una base de personalidad, es cierto que luego evolucionan, pero la base sigue estando. Luffy no es un asesino, derrota a sus enemigos haciéndoles perder su orgullo o su poder, pero no su vida. El único que puede ver ver sus manos con la sangre de alguien que mató y no sentirse mal es Zoro, y no porque sea un demonio, sino porque así es la mentalidad de alguien que usa una espada. Así que por ese lado no creo que comiencen a matar gente de esa manera.
En cuanto a eso de "verdaderos piratas", si has leído todo lo que va del manga hasta ahora, deberías saber que en ese mundo no hay una regla para ser pirata, es más un conjunto de convicciones que de acciones. De hecho se lo asocia más que nada con ser libre y perseguir sus sueños (sea cual sea, los malos también sueñan

). Comprendo que tengas esa visión de lo que es un pirata, y quizás te identifiques más con un Kidd, pero no esperes que cambien el perfil de los mugis. Imaginate que Goku se convierta en un mercenario galáctico como sus antecesores, arruinás el eje de la historia.
Por último y esto es solo una teoría, pienso que esa destrucción de la isla Gyojin se deberá a que querrá hacer que sus habitantes vayan a la superficie, a bordo de Noah, y al ver el miedo y negatividad de estos, se vea obligado a destruir su ciudad. Una "liberación" similar a la que hizo con la habitación de Nami en Arlong Park.